โรงพยาบาลสังขละบุรีได้ถือกำเนิดขึ้นมาจาการดำริของหลวงพ่ออุตตมะ
เปิดโรงพยาบาลเป็นโรงพยาบาลชุมชนขนาด 10 เตียง เมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2528
เปิดเป็น รพช. 30 เตียงอย่างเป็นทางการเมื่อ 3 มีนาคม 2530
เป็นแม่ข่ายรับผู้ป่วยจาก รพ.สต. 6 แห่ง, สสช. 1 แห่ง, รพ.คริสเตียนฯ และผู้ป่วยจากประเทศเมียนมาร์
ปี 2558 ได้เพิ่มศักยภาพงานบริการด้านศัลยกรรมโดยศัลยแพทย์ผู้เชี่ยวชาญ (Part Time)
ปี 2559 สามารถเปิดบริการหน่วยทดแทนไตขึ้นโดยมีชุมชนเป็นแรงขับเคลื่อนให้สำเร็จ